题目内容 (请给出正确答案)
[主观题]

2. 用EMBL双序列比对工具(http://www.ebi.ac.uk/Tools/psa)对下列两条序列作两次全局比对(Needle算法),第一次设置GAP OPEN=10,GAP EXTEND=0.5;第二次设置GAP OPEN=1,GAP EXTEND=5。其他参数默认。给出两次序列比对结果页面屏幕截图。你觉得哪一次的序列比对的结果更佳,给出你的评判标准。 >seq_1 VKCRLNVLLWYQDAYGEVEINDGKLYDAYVSYSDCPEDRKFVNFILKPQLERRRGYKLFL DDRDLLPRAEPSADLLVNLSRCRRLIVVLSDAFLSRAWCSHSFREGLCRLLELTRRPIFI TFEGQRRDPAHPALRLLRQHRHLVTLLLWRPGSVTPSSDFWKEVQLALPRKVQYRPVEGD PQTQLQDDKDPMLILRGRVPEGRAL >seq_2 MLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRFHAFISYS

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B
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第1题

多序列比对运用局部比对,单序列与数据库比对常运用全局比对。
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第2题

NCBI BLAST工具只能进行核苷酸序列比对(blastn)和蛋白质序列比对(blastp)。
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第3题

多序列比对就是两条以上的序列进行比对,可以用于进化树分析、寻找保守区域等。
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第4题

NCBI BLAST工具只能进行核苷酸序列比对(blastn)和蛋白质序列比对(blastp)。
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第5题

进行序列比对需要的两个要素是

A.得分矩阵

B.比对算法

C.物种信息

D.序列长度

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第6题

比对两条分别长7和9的序列,需要画多大的动态规划矩阵?()

A.7*9

B.8*10

C.6*8

D.以上都不对

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第7题

两条序列,绝大部分区域都很相似,只是其中一条序列的一个功能区在另一条序列中是缺失的。如果想要通过双序列比对把这个功能区找出来,我们应该怎么设置gap?

A.gap_open大,gap_extend小

B.gap_open小,gap_extend小

C.gap_open小,gap_extend大

D.gap_open大,gap_extend大

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第8题

下列关于BLAST软件说法正确的是 。

A.BLAST是一种局部比对算法

B.BLAST集成了多种不同的比对程序,用于实现不同的搜索目的

C.BLAST过程随着查询序列长度的增加,比对速度会越来越快

D.BLAST常用的目标数据库的类型有核苷酸和蛋白质序列两种

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第9题

为附件中exercise1.fasta中的5条序列创建多序列比对。多序列比对工具自选。比对结果保存后通过JalView,以Clustalx颜色方案标记。将编辑后的多序列比对保存为图片提交。注意调整图片宽度及文字大小。自己尽量多的尝试一下JalView的各种功能,参考help。 JalView下载:附件中可下载Windows版JalView安装包(不含JAVA,JAVA安装参见第二章第二部分第7节:PDB文件3D展示Jsmol_附件) 课程不支持大于50M的附件上传,如需下载自带JAVA安装的Jalview安装文件或其他版本安装文件,请前往Jalview官网下载:https://www.jalview.org/Web_Installers/install.htm
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