绿藻色素体和蛋白核的形状、数目和排列方式常为分类的依据。

蛋白核由蛋白质核心和淀粉鞘组成，与蛋白质的形成有关，其构造、形状、数目和位置是分类上的依据。

放线菌孢子的形状和排列方式是稳定的，可以作为分类依据。

放线菌孢子丝的形状和排列方式是稳定的，可以作为分类依据。

甲片式表示甲藻纤维质小板嵌合而成的细胞壁上、下甲板片的数目、形状和排列方式的式子，为分类的重要依据之一。

新月藻为单细胞，新月形，细胞壁光滑，具纵向的线纹、肋纹或纵向的颗粒，每个半细胞具1个色素体，蛋白核多数，纵向排列成一列或不规则散生，细胞两端各具1个液泡，含一或多个石膏结晶，细胞核位于两色素体之间的细胞中部。

蓝藻又称蓝细菌，是因为蓝藻与细菌相似，没有真正的细胞核，没有蛋白核，没有色素体，没有细胞器，细胞壁具有粘质缩氨肽，繁殖方法最简单。

衣藻是单细胞个体，色素体大型，1个，杯状、片状或星状，具1个蛋白核，少2个或多个，具2条顶生等长鞭毛，可运动。

压延机可以按照辊筒数目和辊筒排列形式进行分类（）。

不同种的杆菌在细胞分裂时可形成不同的空间排列方式，常被作为分类依据。

不同种的杆菌在细胞分裂时可形成不同的空间排列方式，常被作为分类依据。