一、对给出序列进行数据库相似性搜索BLAST，确定其编码的基因（1）选择数据库相似性搜索程序：你可能选择BLAST或FASTA服务器： BLAST （2）进入NCBI的BLAST主页，根据要分析序列和目的选择所用的程序：nucleotide BLAST （3）复制所给的核酸序列未知核酸序列如下： AAAAGAAAAGGTTAGAAAGATGAGAGATGATAAAGGGTCCATTTGAGGTTAGGTAATATGGTTTGGTATCCCTGTAGTTAAAAGTTTTTGTCTTATTTTAGAATACTGTGATCTATTTCTTTAGTATTAATTTTTCCTTCTGTTTTCCTCATCTAGGGAACCCCAAGAGCATCCAATAGAAGCTGTGCAATTATGTAAAATTTTCAACTGTCTTCCTCAAAATAAAGAAGTATGGTAATCTTTACCTGTATACAGTGCAGAGCCTTCTCAGAAGCACAGAATATTTTTATATTTCCTT

答案

BLAST;FASTA;SSEARCH;BLAT

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更多“一、对给出序列进行数据库相似性搜索BLAST，确定其编码的…”相关的问题

第1题

关于tBLASTx描述正确的是：

A.是一个为核酸序列进行相似性搜索的工具

B.其搜索的数据库是核酸数据库

C.其搜索的核酸数据库里的核酸序列要先被翻译成6条蛋白质序列

D.要进行相似性搜索的核酸序列需要先被翻译成6条蛋白质序列

E.是一个蛋白质数据库

F.是一个核酸数据库

G.是一个为蛋白质序列进行相似性搜索的工具

H.其搜索的数据库是蛋白质数据库

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第2题

二、对给出的氨基酸序列进行相似性比较，确定其编码的蛋白质（1）选择序列联配程序BLAST或FASTA：如BLAST （2）进入NCBI的 BLAST主页，根据要分析序列和目的选择所用的程序：BLAST Protein （3）复制以下蛋白质序列：未知氨基酸序列如下： MSTAVLENPGLGRKLSDFGQETSYIEDNCNQNGAISLIFSLKEEVGALAKVLRLFEENDVNLTHIESRPSRLKKDEYEFFTHLDKRSLPALTNIIKILRHDIGATVHELSRDKKKDTVPWFPRTIQELDRFANQILSYGAELDADHPGFKDPVYRARRKQFADIAYNYRHGQPIPRVEYMEEEKKTWGTVFKTLKSLYKTHACYEYNHIFPLLEKYCGFHEDNIPQLEDVSQFLQTCTGFRLRPVAGLLSSRDFLGGLAFRVFHCTQYIRHGSKPMYTPEPDICHELLGHVPLFSDRSFAQFSQEIGLASLGAPD

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第3题

常用的确定蛋白质功能的方法就是对数据库的序列信息进行相似性搜索。

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第4题

选择一条具有完整编码区（CDS）的mRNA序列（每人1题，如相互之间序列完全一致，均判0分），要求含有5'-UTR、CDS及3'-UTR。应用BLAST在线分析工具，在核苷酸和氨基酸水平上进行序列同源性比对搜索，分析该基因及其编码的蛋白质与数据库中哪些物种（每种分析至少5个物种，并标注每个物种的中文名称、拉丁文（斜体）及序列登录号）的基因或蛋白质具同源性（关键步骤和FASTA格式序列以截图的形式粘贴到Word文档中，并以附件上传）。

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第5题

下列关于BLAST软件说法正确的是。

A.BLAST是一种局部比对算法

B.BLAST集成了多种不同的比对程序，用于实现不同的搜索目的

C.BLAST过程随着查询序列长度的增加，比对速度会越来越快

D.BLAST常用的目标数据库的类型有核苷酸和蛋白质序列两种

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第6题

应用BLAST在线分析工具，在核苷酸和氨基酸水平生进行序列同源性比对搜索，分析该基因及其编码的蛋白质与哪些物种已经鉴定的基因或蛋白质存在高同源性。

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第7题

3. 用NCBI的标准BLAST搜索Swissprot数据库中与如下序列最相似的人[Homo sapiens]的序列，给出操作过程及结果（屏幕截图即可）。 >seq LYFDLPWYVRMLCQWTQTRHRARHIPLEELQRNLQFHAFVSYSGHDSAWVKNELLPNLEKD DIQICLHERNFVPGKSIVENIINFIEKSYKSIFVLSPHFIQSEWCHYELYFAHHNLFHEGS DNLILILLAPIPQYSIPTNYHKLKTLMSRRTYLEWPTEKNKHGLFWANLRASINVKLVNQA EGTCYTQQ

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第8题

基于灰度的配准算法的要素主要有相似性度量、搜索策略和模板窗口大小的选择。

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第9题

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第10题

基于灰度的配准算法的要素主要有相似性度量、搜索策略和模板窗口大小的选择。

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