题目内容 (请给出正确答案)
[单选题]

2、下列关于序列的两两比对与多序列比对概念的说法不正确的是 。

A.两两比对指的是两条序列之间的对齐过程

B.多序列比对指的是三条或三条以上的序列进行对齐的过程

C.两两比对通常需要以多序列比对为基础进行扩展

D.BLAST输出的结果属于两两比对的形式

答案
两两比 对 通常需要以多序列比 对为 基 础进 行 扩 展
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第1题

关于序列比对程序BLAST,下列说法不正确的是?

A.Blast可以帮助确定蛋白质序列的保守区域

B.Blast能分析两条不同序列之间的同源性

C.Blast可比对多个蛋白质序列的同源性

D.Blast能比对两个药物分子的理化性质

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第2题

多序列比对就是两条以上的序列进行比对,可以用于进化树分析、寻找保守区域等。
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第3题

多序列比对运用局部比对,单序列与数据库比对常运用全局比对。
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第4题

10、多序列比对特别适合相似程度很小的序列进行比对。
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第5题

二,多序列比对题 1. 检索并下载 NP_850469.1、NP_191786.1、NP_187296.2、NP_172999.1、NP_177619.2、NP_197925.4、NP_194977.6 等蛋白质序列并建立Fast格式的txt文档(2分) 2. 登录http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/,使用默认参数对上述序列进行多序列比对,查看比对结果、系统发生树,下载Alignment File(4分) 3. 使用ClustalX1.8、DNAMAN、BioEdit软件对上述序列进行多序列比对,制作美观的多序列比对图片,观察比对结果有何差异(4分) (关键步骤和结果请截图粘贴至WORD文档上传)
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第6题

下列对全局比对和局部比较描述最准确的是哪一项

A.全局比对通常用于比对核酸序列,局部比对用于比对蛋白质序列

B.全局比对效率高于局部比对

C.全局比对寻找全局最大化,局部比对寻找局部最大化

D.全局比对比对整体序列,局部比对寻找最佳匹配子序列

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第7题

2、2. 用EMBL双序列比对工具(http://www.ebi.ac.uk/Tools/psa)对下列两条序列作两次全局比对(Needle算法),第一次设置GAP OPEN=10,GAP EXTEND=0.5;第二次设置GAP OPEN=1,GAP EXTEND=5。其他参数默认。给出两次序列比对结果页面屏幕截图。你觉得哪一次的序列比对的结果更佳,给出你的评判标准。 >seq_1 VKCRLNVLLWYQDAYGEVEINDGKLYDAYVSYSDCPEDRKFVNFILKPQLERRRGYKLFL DDRDLLPRAEPSADLLVNLSRCRRLIVVLSDAFLSRAWCSHSFREGLCRLLELTRRPIFI TFEGQRRDPAHPALRLLRQHRHLVTLLLWRPGSVTPSSDFWKEVQLALPRKVQYRPVEGD PQTQLQDDKDPMLILRGRVPEGRAL >seq_2 MLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRFHAFIS
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第8题

2. 用EMBL双序列比对工具(http://www.ebi.ac.uk/Tools/psa)对下列两条序列作两次全局比对(Needle算法),第一次设置GAP OPEN=10,GAP EXTEND=0.5;第二次设置GAP OPEN=1,GAP EXTEND=5。其他参数默认。给出两次序列比对结果页面屏幕截图。你觉得哪一次的序列比对的结果更佳,给出你的评判标准。 >seq_1 VKCRLNVLLWYQDAYGEVEINDGKLYDAYVSYSDCPEDRKFVNFILKPQLERRRGYKLFL DDRDLLPRAEPSADLLVNLSRCRRLIVVLSDAFLSRAWCSHSFREGLCRLLELTRRPIFI TFEGQRRDPAHPALRLLRQHRHLVTLLLWRPGSVTPSSDFWKEVQLALPRKVQYRPVEGD PQTQLQDDKDPMLILRGRVPEGRAL >seq_2 MLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRFHAFISYS
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第9题

选择感兴趣的一个具有完整编码区(CDS)的mRNA序列(每人1题,相互之间序列完全一致,均判0分),要求含有5’-UTR、CDS及3’-UTR。以该基因编码的蛋白序列为目的序列进行BlastP分析。在分析结果中下载与目的蛋白序列高同源的搜索蛋白序列,应用DNAMAN 5.0软件进行多序列比对。 要求:提交PDF格式文档至《生物信息学》精品在线开放课程平台。 注明该基因及其编码的蛋白质的序列号及蛋白质的主要生物学功能; 列出进行多序列比对的全部蛋白质的fasta格式序列; 应对5-10条蛋白序列进行多序列比对,每条序列以“序列号”命名。
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第10题

2. 用EMBL双序列比对工具(http://www.ebi.ac.uk/Tools/psa)对下列两条序列作两次全局比对(Needle算法),第一次设置GAP OPEN=10,GAP EXTEND=0.5;第二次设置GAP OPEN=1,GAP EXTEND=5。其他参数默认。给出两次序列比对结果页面屏幕截图。你觉得哪一次的序列比对的结果更佳,给出你的评判标准。 >seq_1 VKCRLNVLLWYQDAYGEVEINDGKLYDAYVSYSDCPEDRKFVNFILKPQLERRRGYKLFL DDRDLLPRAEPSADLLVNLSRCRRLIVVLSDAFLSRAWCSHSFREGLCRLLELTRRPIFI TFEGQRRDPAHPALRLLRQHRHLVTLLLWRPGSVTPSSDFWKEVQLALPRKVQYRPVEGD PQTQLQDDKDPMLILRGRVPEGRAL >seq_2 MLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRFHAFISYS
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